В ближайщем будущем компьютерный хакер Нео обнаруживает, что вся жизнь на Земле можеть быть не больше чем детально разработанной видимостью, созданной недоброжелательным кибер-разумом, с целью успокоить нас, в то время как наша жизненная сущность "арендуется" для поддержки господства Матрицы в "настоящем" мире. Он присоединяется к повстанцам Морфеусу и Тринити в их борьбе за уничтожение Матрицы.